个人独资公司在办理注册的时候需要准备的材料：申请表、投资人基本情况、居住证明、相关评估材料等。个人独资公司的设立，必须提供以上所列的各种证明文件，才能得到法律上的确认，具体情况这要看工商管理部门的意见。
一、个人独资公司注册时需要准备哪些资料?
(一)由投资者签署的设立个人独资公司申请书;
(二)投资者的身份证明;
(三)公司的住所证明;
(四)国家工商行政管理总局要求的其他文件。
开展法律、行政法规规定必须报有关部门批准的业务的，必须将批准文件送交有关部门。
委托代理人申请设立登记的，须出示投资人委托书和代理人身份证明或资格证明。
二、个人独资公司和个体工商户的区别
第一、个人独资公司需要有固定的生产经营场所和法定的公司名称，而个体工商户可以没有公司名称，也可以无固定生产经营场所经营。也就是说，具有合法的公司名称和固定的生产经营场所是设立个人独资公司的条件，而不是个体工商户成立的条件。
第二、个体工商户的投资人和经营者为同一个人，且均须为投资设立个体工商户的自然人。个人独资公司的投资人和经营者可以是不同的人，投资人可以委托或者聘请他人管理个人独资企业的事务。也就是说，个人独资公司的所有权和经营权可以分离，这决定了个人独资企业更符合现代商业制度的特点。但是，个体工商户的所有权和经营权归于出资人，已经不能适应现代企业制度发展的要求，只能适用于小规模经营单位。
第三、个人独资公司可设立分支机构，也可委托他人负责个人独资企业的分支机构。该规定表明，个人独资企业不仅可以在登记管理机关管辖范围内设立分支机构，也可以在异地设立分支机构，设立分支机构的个人独资企业必须承担责任。个体工商户按规定不得设立分支机构。另一方面，虽然个体工商户可以异地经营，但随着近年来各地陆续简化外国人登记手续，个体工商户异地经营的要求逐渐弱化。由此可见，个人独资企业的总体范围普遍大于个体工商户。
第四、个人独资企业和个体工商户的法律地位不一样。在民事、行政和经济法律体系中，个人独资公司是能够以企业名义进行合法活动的其他组织或其他经济组织的一种形式。个体工商户是否可以作为其他组织或其他经济组织的形式，一直是国内民事法学家争论不休的话题。在日常法律活动中，个体工商户的法律行为能力往往受到一定程度的限制。更多的时候，个体工商户以公民个人的名义进行合法活动。事实上，国内很多法律专家都指出，个体工商户不是法律意义上的企业。此外，个人独资企业和个体工商户在作为市场主体参与其他市场经济活动的能力上也存在差异。比如，个人独资公司可以成为公司的股东，因此，以公司的名义，享受公司的股东权益与责任。而个体经营者通常不能以公司的名义成为公司的股东，而只能以个人(自然人)的形式加入公司。
第五、个人独资公司和个体工商户对财务制度和税收政策的要求不同。这其实也是投资者比较关心的事情。按照《个人独资企业法》的规定，个人独资公司必须建立会计核算的财务制度。值得一提的是，个人独资公司的财务制度是个人独资公司的必要条件，不会因任何部门的要求而改变。但是，由于我国个体工商户情况比较复杂，关于是否要建立一个新的会计体系，存在着诸多争议，新的《会计法》仅对此作出了一些原则上的规定。
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